Guaraqueçaba, uma pequena cidade encravada entre a Serra do Mar e a Baía de Paranaguá, foi o cenário das primeiras colonizações no estado e também abriga a exuberância da Mata Atlântica, sendo ainda uma das poucas regiões no Brasil onde a floresta tropical continua intocada. Todo o município está em área de proteção ambiental, devido a sua importância ecológica, desde a criação da APA Federal e Estadual de Guaraqueçaba, em 1985, com uma área de mais de 300 mil hectares englobando o Parque Nacional do Superagüi, a Estação Ecológica de Guaraqueçaba e a Reserva Natural de Salto Morato. A região junto com Cananéia e Iguape, no litoral sul de São Paulo, formam o maior trecho contínuo remanescente original da Mata Atlântica, conhecido como Lagamar. Este pedaço do Brasil recebeu em 1993 o reconhecimento da UNESCO como Reserva da Biosfera, devido a sua importância, e em 1999, também pela UNESCO como Sitio do Patrimônio Mundial.
Guaraqueçaba é um vocábulo indígena que, segundo Silveira Bueno, significa ninho das garças. Do tupi guará: garça; e qüessaba ou quiçaba: lugar de dormir, ninho.
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